本季描繪重返醫(yī)院的牧野醫(yī)生與升入初中的學生們的新篇章。藤野一希難以適應中學生活，父親突然帶回新母親與妹妹更令其家庭歸屬感崩塌；而順利完成心臟病手術的冴島直明升入新年級，雖立志成為牧野醫(yī)生般的醫(yī)者，內心仍懷不安。此時，一名因病復發(fā)失去求生意志的少女出現(xiàn)在牧野面前。除原作劇情外，本季將新增原創(chuàng)角色故事線。